หลักสูตรลุ่มน้ำโขงศึกษาเป็นหลักสูตรเชิงประยุกต์ที่เน้นการวิจัยข้ามวัฒนธรรม โดยเฉพาะอย่างยิ่งทางด้านชาติพันธุ์ ประวัติศาสตร์ ภาษาและวรรณกรรม ปรัชญาและศาสนา เพื่อสร้างความเข้าใจอย่างลึกซึ้งต่อพื้นที่ลุ่มน้ำโขง ซึ่งเป็นพื้นที่สำคัญด้านยุทธศาสตร์การวิจัยของประเทศและนานาชาติ โดยให้ความสำคัญกับประเด็นความหลากหลายทางสังคมวัฒนธรรมลุ่มน้ำโขงเป็นหลัก
